提示: 使用扩展搜索模式可以增加上下游范围,提高找到同源区域的几率。
同源区域定义
本工具检索的同源区域基于hg38参考基因组,具有以下特征:
- 片段长度:≥ 10,000 bp (10 kbp)
- 同源比例:≥ 98% 序列相似性
- 数据来源:基于UCSC Genome Browser的SegDup数据
示例查询:
- SMN1 - 基因名称查询(脊髓性肌萎缩症相关基因)
- 16p11.2 - 核型表示法(16号染色体短臂11.2区)
- 22q11.2 - 核型表示法(DiGeorge综合征区域)
- chr1:16761934-16799163 - hg38坐标查询
- chr1:16751934-16789163 - hg19坐标查询(需选择hg19版本)
- BRCA1 - 另一个基因示例
搜索结果
IGV 基因组浏览器视图(hg38)- 展示检索区域及其同源片段相对位置
当前核型区带:--